在Xgrid上运行Gate

1. cluster上有xserve1-xserve11共11个nodes，其中xserve1运行xgrid controller，其他10个nodes运行xgrid agent

2. xserve1上成功安装了Gate 3.1.1在/Applications/Gate下面，包括四个目录CLHEP    gate_v3.1.1     geant4.8.1.p02  root-5.12，分别安装了相应的package，另外有一个script文件：setupgate，用以启动Gate之前设置环境变量。

#!/bin/tcsh
setenv  ROOTSYS "/Applications/Gate/root-5.12/"
setenv G4INSTALL "/Applications/Gate/geant4.8.1.p02/"
setenv G4WORKDIR  "/Applications/Gate/geant4.8.1.p02/"
setenv G4VERSION "8.1"
setenv GATEHOME "/Applications/Gate/gate_v3.1.1"
setenv LD_LIBRARY_PATH "${ROOTSYS}/lib"
setenv DYLD_LIBRARY_PATH "${ROOTSYS}/lib"
set path = ($path ${ROOTSYS}/bin ${GATEHOME}/bin/Darwin-g++)
source /Applications/Gate/gate_v3.1.1/env_gate.csh

3. 在本地desktop上运行xgrid:

3.1 创建临时文件夹 tmp_input，把所有.mac文件（以及GateMaterials.db 和 Materials.xml）都放进去；
3.2 创建临时文件夹 tmp_output，准备放xgrid传回来的输出文件；
3.3 编写script文件xgrid_job1：

#!/bin/tcsh
source /Applications/Gate/setupgate
Gate < mosaic.mac

3.4 运行

 xgrid -h xserve1.local -p password -in tmp_input -out tmp_output -job run xgrid_job1

3.5 结束后到tmp_output检查结果。